Will man in einem selbst geschriebenen Plugin jQuery/JS verwenden, kann das so lösen:
public function myTriggerFunktion(&$params){
// Optional übergebener Parmeter vom Trigger
$check = $params['check'];
$doc = JFactory::getDocument();
// JS direkt in der Funktion
$doc->addScriptDeclaration("alert($check);");
// Eingebundene Javascriptdatei
$doc->addScript(JURI::base().'plugins/system/pathToPluginJS/my.js', 'text/javascript');
}